เมืองแห่งการศึกษาขนาดใหญ่ “นครแห่งการศึกษา” ตั้งอยู่ทางตะวันตกของกรุงโตเกียว

เมืองแห่งนี้มีประชากรรวมทั้งสิ้นถึง 2.3 ล้านคน และในจำนวนนั้นประมาณ 80% เป็นนักเรียน ภายในเมืองมีการจัดหลักสูตรพิเศษเพื่อพัฒนาความสามารถเหนือธรรมชาติของเหล่านักเรียน โดยความสามารถของแต่ละคนจะถูกประเมินออกเป็น 6 ระดับ ตั้งแต่ “ผู้ไร้ความสามารถเลเวล 0” ไปจนถึง “ผู้มีพลังเหนือมนุษย์เลเวล 5”

ที่นี่มีเทคโนโลยีทางวิทยาศาสตร์อันล้ำหน้า ซึ่งล้ำหน้าเกินสามัญสำนึกของโลกภายนอก และเป็นสถาบันการศึกษาราวกับความฝันที่ทุกคนสามารถได้รับความสามารถผ่านกระบวนการทางวิทยาศาสตร์และใช้ชีวิตได้อย่างปลอดภัย

ทว่าเบื้องหลังความสงบสุขนั้นมีองค์กร “ด้านมืด” อาศัยอยู่ นั่นคือกลุ่มที่รับทำงานสารพัดสกปรก ซึ่งไม่อาจถูกเปิดเผยต่อสาธารณชนได้โดยเด็ดขาด

“ไอเทม” คือหน่วยรบชั้นยอดที่ประกอบด้วยเด็กสาวทั้งสี่คน

ไซไอ คินุฮาตะ ผู้ควบคุมไนโตรเจนได้อย่างอิสระ และรับหน้าที่เป็นแนวป้องกันอันแข็งแกร่งราวกับกำแพงเหล็ก

เฟรนด้า เซเวลุน ผู้ใช้ระเบิดและกับดักหลากหลายรูปแบบ เพื่อพลิกสถานการณ์และปั่นป่วนสนามรบ

ริโค ทาคิสึโบะ ผู้สามารถอ่านจับพลังอันแผ่วเบาที่ปล่อยออกมาจากผู้มีพลังพิเศษ เพื่อติดตามร่องรอยของเป้าหมาย

และ ชิสึริ มุกิโนะ ผู้เป็นหนึ่งใน “ผู้มีพลังเหนือมนุษย์เลเวล 5” หนึ่งในเจ็ดคนที่มีอยู่ในนครแห่งการศึกษา

อยู่ ๆ มีเด็กสาวคนหนึ่งปรากฏตัวต่อหน้าซึ่งเป็น “สมาชิกคนที่ห้า”

การพบพานกับเด็กสาวคนนั้น จะนำพา “ไอเทม” ไปสู่ความมืดมิดครั้งใหม่

นี่คือเรื่องราวของชีวิตประจำวัน ความผูกพัน และ “ความมืด” ที่ลึกลงไปถึงเบื้องลึกของเด็กสาวผู้มีพลังพิเศษเหล่านี้ เด็กสาวที่ใช้ชีวิตอยู่ท่ามกลางความรุนแรง ความโหดร้าย และความเสื่อมทราม

ซึ่งเป็นเรื่องราวของเหล่าเด็กสาวผู้มีพลังพิเศษที่ค่อนข้างจะแปลกประหลาดไม่น้อย